برای سازمان‌ها
یک سرویس نرم‌افزاری کنترل‌شده برای آزمایشگاه‌ها، گروه‌های مهندسی و محیط‌های آموزشی روی زیرساخت تحت کنترل سازمان ایجاد کنید.
بازارچهٔ نرم‌افزار
GROMACS
دینامیک مولکولی
در دسترس بنا به درخواست
دینامیک زیست‌مولکولی با توان عملیاتی بالا برای پروتئین‌ها، لیپیدها و اسیدهای نوکلئیک، با گروه‌های تکرار مستقل و MPI چندنودی برای سامانه‌هایی که به آن نیاز دارند.
MPI
اجرای دسته‌ای
اجرای گروهی
سرویس نرم‌افزار علمی مدیریت‌شده برای سازمان شما
نرم‌افزارهای تأییدشده و اجرای بازتولیدپذیر را در اختیار تیم‌های پژوهش و مهندسی بگذارید، بدون آنکه کاربران یا تیم زیرساخت هر پشتهٔ نرم‌افزاری را نگه‌داری کنند.
کاربران شما چه کارهایی می‌توانند انجام دهند
یک نرم‌افزار در دسترس را انتخاب کنند، شبیه‌سازی را پیکربندی و ثبت کنند، اجرا را پیگیری کنند، لاگ و وضعیت را ببینند و نتایج ثبت‌شده را دریافت کنند.
تیم زیرساخت شما چه امکاناتی در اختیار دارد
نرم‌افزارها و نسخه‌های تأییدشده، یکپارچه‌سازی لایسنس، دسترسی، سهمیهٔ منابع، سیاست اجرا، محل نگه‌داری داده و سابقهٔ اجرا را کنترل می‌کند.
WECORE چگونه آن را مستقر و بهره‌برداری می‌کند
نرم‌افزارها را بسته‌بندی و اعتبارسنجی می‌کنیم، سرویس را روی زیرساخت OpenStack شما مستقر می‌کنیم، در صورت نیاز لایسنس را یکپارچه می‌کنیم و بهره‌برداری مستمر را بر عهده می‌گیریم.
نمای کلی
آشنایی با GROMACS.
GROMACS موتور دینامیک مولکولی است که برای سامانه‌های زیست‌مولکولی نوشته شده و به‌شدت برای توان عملیاتی تنظیم شده است.
روال‌های محاسباتی برهم‌کنش‌های غیرپیوندی آن برای معماری‌های جدید CPU بهینه شده‌اند و MPI از سامانه‌هایی پشتیبانی می‌کند که به بیش از یک نود نیاز دارند.
کاربردها
کاربردهای این نرم‌افزار.
تاخوردگی پروتئین و نمونه‌برداری همساخت‌ها
مطالعه‌های تاخوردگی و نمونه‌برداری همساخت‌ها را آن‌قدر طولانی اجرا کنید که حرکت‌های کند خود را نشان دهند.
سامانه‌های غشایی و دولایهٔ لیپیدی
دولایه‌های لیپیدی را بسازید و به تعادل برسانید، سپس پروتئین‌های غشایی را در محیط لیپیدی واقع‌نما اجرا کنید.
اتصال پروتئین و لیگاند و انرژی آزاد
انرژی آزاد اتصال پروتئین و لیگاند را با پنجره‌های اغتشاش انرژی آزاد برآورد کنید که هرکدام شبیه‌سازی مستقلی در صف دارند.
اسیدهای نوکلئیک و اجراهای تولیدی طولانی
سامانه‌های اسید نوکلئیک و کارزارهای تولیدی طولانی را اجرا کنید که روش‌های گروهی به آنها متکی‌اند.
حالت‌های اجرا
نرم‌افزار در محیط مدیریت‌شده چگونه اجرا می‌شود.
اجرای دسته‌ای مدیریت‌شده
اجرای گستردهٔ گروه تکرارها
به‌جای یک اجرای بسیار بزرگ، تعداد زیادی تکرار مستقل را به صف بفرستید؛ بیشتر شبیه‌سازی‌های GROMACS چنین ساختاری دارند. برای سامانه‌ای که واقعاً به آن نیاز دارد، MPI چندنودی نیز قابل پیکربندی است.
اجرای دسته‌ای مدیریت‌شده
MPI تک‌نودی یا چندنودی
برای توان عملیاتی، اجرای تک‌نودی را انتخاب کنید؛ اگر یک سامانه به حافظه یا ظرفیت محاسباتی بیشتری نیاز دارد، از MPI چندنودی استفاده کنید.
در دسترس بنا به درخواست
نرم‌افزار علمی را بدون مدیریت کلاستر اجرا کنید.
بگویید به کدام نرم‌افزار علمی نیاز دارید و می‌خواهید از آن چگونه استفاده کنید.